冷凍干燥的整個過程其實就是傳熱和傳質(水蒸氣)同時進行的過程，熱和質的傳遞速率共同影響干燥速率，從而影響整個凍干周期，所有影響熱和質傳遞的因素均會影響干燥速率，簡單分析如下：

　　1、物料的形態與組分

　　冷凍干燥機根據凍干物料的形態通常分為固體和液體。固體的形態和液體的濃度對冷凍干燥速率的影響較大。

　　2、預凍速率

　　冷凍時所形成的晶體大小在很大程度上影響干燥的速率和干燥后產品的溶解速度。速凍和慢凍過程具有以下差別：速凍產生的冰晶較小，慢凍產生的冰晶較大。大的冰晶有利于升華，小的冰晶不利于升華，快速凍結導致升華速率低，解吸速率快；慢速凍結導致升華速率快，解析速率慢。

　　3、裝量

　　物料在凍干時，分裝到容器中后存在一定的表面積與物質厚度之比，亦即凍干與裝量有關。表面積、厚度小有利于水分升華，容易凍干且質量理想。干燥時，單位面積料盤上被干燥的濕重裝載量是決定干燥時間的重要因素，一般情況下，物料堆積的厚度愈薄，傳熱和傳質速度越快，干燥時間愈短。但是，物料厚度薄則單位凍干面積上每批次干燥的物料少，對提高單位凍干面積和單位時間產量不利。

　　4、干燥室內壓力

　　干燥室內壓力高低影響到傳熱和傳質的速率，就傳質而言，壓力越低越好，而對于傳熱來說，壓力越高越好。傳質速率的大小，主要由升華界面與干燥層表面的溫度和壓力所決定，要提高干燥層中水蒸氣的逸出速率，一是提高升華界面的溫度，使界面水蒸氣壓增大；二是提高干燥室的真空度，降低干燥層表面的蒸汽壓。

　　5、傳熱方式傳熱方式

　　按傳統的分類可劃分為：傳導、對流、熱輻射和介質加熱(微波加熱)。由于升華干燥的過程涉及到熱和質(水蒸氣)的傳遞，因此，通過何種傳熱方式將熱量更為有效地傳給物料，對干燥速率有較大的影響。

　　所以，無論是為了冷凍干燥機的使用速率還是使用安全，我們都需要在使用過程中注意一些事項：

　　1、制備樣品應盡可能擴大其表面積，其中不得含有酸堿物質和揮發性有機溶劑；

　　2、樣品必須完全凍結成冰，如有殘留液體會造成氣化噴射；

　　3、注意冷阱約為零下65度，可以做低溫冰箱使用，但必須戴保溫手套操作防止凍傷；

　　4、啟動真空泵以前，檢查出水閥是否擰緊，充氣閥是否關閉，有機玻璃罩與橡膠圈的接觸面是否清潔無污物，良好密封；

　　5、一般情況下，該機不得連續使用超過48小時；

　　6、樣在冷凍過程中，溫度逐漸降低，可以將樣品取出回暖一段時間后(仍處于冰凍狀態)，繼續干燥，以縮短干燥時間。

　　對于冷凍干燥機的運行來說，既然有好的開始，那么關機停運時自然也不能馬虎，也要按照正確的步驟來操作關機。

　　1、將快速充氣閥接嘴插入快速充氣閥座，同時關“真空泵”電源開關，使空氣緩緩進入冷肼；如需充入惰性氣體，則將惰性氣體的減壓導管連接“充氣口”；

　　2、關閉“真空計”、“制冷機”，如長期不用應拔掉電源線；

　　3、提起有機玻璃罩，將物品取出，保存，冷凍干燥結束；

　　4、冷肼中的冰化成水后，需將水從快速充氣閥口排除，操作與充氣相似；

　　5、清理冷肼中的水分和雜質，妥善保養設備；

　　6、多歧管型，應逐個關閉橡膠閥并取下凍干瓶后再重復關機操作。